Есть ли возможность в системе маркировки Честный знак для лекарственных препаратов изменить цену товара при реализации? 

Если при приемке/отгрузке была указана некорректная стоимость лекарственного препарата (ЛП), ее можно скорректировать с помощью 254 схемы.

Переоценка лекарственных препаратов перед розничной реализацией не предусмотрена в системе как самостоятельный бизнес-процесс. 

В системе маркировки Честный знак для лекарственных препаратов Участники оборота товаров передают сведения о стоимости ЛП при продаже другим юридическим лицам (стоимость, которая указывается, например, в 415/416 схемах) и о стоимости при продаже при конечной реализации (стоимость, которая указывается, например, в 10511 / 511). При подаче сведений в систему маркировки необходимо указывать корректную цену лекарственных препаратов (ЛП). В системе маркировки фиксируется фактическая стоимость единицы потребительской упаковки ЛП, которая должна соответствовать стоимости единицы потребительской упаковки ЛП, отраженной в сопроводительной документации.

Стоимость, за которую был продан ЛП, указывается в чеке, который через ОФД (оператора фискальных данных) попадает в систему маркировки и указывается в 10511 схеме. Таким образом, если ЛП был продан по определенной цене, то она и будет указана в 10511 схеме. Ограничения со стороны системы маркировки по данному поводу не устанавливаются.

Подробнее о схемах в документах: "Паспорта процессов", "Описание XSD-схем", образцы схем архивом.