Каким образом резиденты РФ могут осуществить передачу препаратов на непризнанные республики (Южная Осетия, Абхазия и т.д)?

Если Вы закупаете препарат, произведенный на территории России, а продавать планируете на непризнанные территории (Южная Осетия), то необходимо использовать операцию №335 с типом 10 (экспорт). Данная операция используется после передачи сведений о нанесении (10311) и агрегации (911/915) и если необходимо о вводе в оборот (По статусной модели на стр.261 схема 335/10 доступна после этапа нанесения).

Если клиент на непризнанной территории не зарегистрирован в системе маркировки Честный знак для лекарственных препаратов, то проводить регистрацию ему не требуется.

Подробнее о схемах в документах: "Паспорта процессов", "Описание XSD-схем", образцы схем архивом.